اولين سنگ مزار حضرت، سنگ مرمري - به ابعاد 40 ضربدر 30 و قطر 6 سانتي‏متر است که در اوايل قرن ششم بر مزار امام عليه‏السلام نصب شده، سطح اين سنگ تاريخي محرابي شکل داراي کتيبه‏اي شبيه به خط کوفي است، در پايان کتيبه نام باني سنگ چنين آمده است: أمر بعمارة المشهد الرضوي علي بن موسي عليه‏السلام العبد المذنب الفقير الي رحمة الله ابوالقاسم احمد بن علي بن احمد العلوي الحسيني. تقبل الله منه و نام سازنده‏ي سنگ که عبدالله بن احمد قره است در ذيل آن به چشم مي‏خورد. اين لوحه‏ي تاريخي بيانگر تعميراتي در حرم مطهر است به لحاظ ارزش تاريخي و هنري آن به موزه انتقال يافت و اکنون مورد بازديد زيارت‏کنندگان آن حضرت است. دومين سنگ، سنگي از جنس مونسار (مرمر سفيد و آهکي بوده) که به جاي آن بر مزار امام عليه‏السلام جاي داشته، آگاهي چنداني از چگونگي آن به دست نيامده است. سومين سنگ، سنگي مرمر ممتاز از معدن توران پشت‏ يزد است، اين سنگ به رنگ سبز چمني با ابعاد 20 / 1 ضربدر 10 / 1 و قطر يک متر و وزن 3600 کيلوگرم، که همزمان با تعويض ضريح پنجم در سال 1379 ه. ش در حرم مطهر بر فراز مرقد منور امام عليه‏السلام نصب شده، بر سطح سنگ القاب امام علي الرضا عليه‏السلام و تاريخ ولادت و شهادت آن بزرگوار و نيز دو بيت از اشعاري که حضرت به قصيده‏ي دعبل ملحق فرموده حک شده است و آياتي از قرآن نيز زينت‏بخش اطراف سنگ مي‏باشد. اين سنگ اکنون در حرم مطهر زير ضريح مقدس جاي دارد. عين متن کتيبه‏ي سطح سنگ مرقد امام عليه‏السلام: هذا هو المرقد الشريف للامام التقي النقي الصديق الشهيد وارث الانبياء و المرسلين، ثامن الأئمة المعصومين من اهل بيت رسول رب العالمين، حجة الله علي الخلق اجمعين، سيدنا و مولانا [ صفحه 39] ابي‏الحسن الرضا علي بن موسي بن جعفر بن محمد بن علي بن الحسين بن ابي‏طالب، صلوات الله عليهم اجمعين. ولد بالمدينة في الحادي‏عشر من ذي‏القعدة عام 148 و استشهد بطوس في آخر صفر ستة 203 من الهجرة النبوية. و قبر بطوس يا لها من مصيبة الحت علي الاحشاء بالزفرات‏ الي الحشر حتي يبعث الله قائما يفرج عنا الغم و الکربات‏ (قبري در توس است، چه عجب مصيبتي است، مصيبت آن با ناله‏هاي دردناک، آتش حسرت را تا روز قيامت در درون مي‏افزود، تا اين‏که خداوند قائمي را برانگيزد و اندوه و سختيها را از ما برطرف سازد.)