بعد از انقلاب اسلامي در زمين‏هائي که در قسمت شمالي مدرسه خيرات خان و مدرسه ميرزاجعفر قرار داشت و در اثر تخريب منازل و بازارها در طرح تخريب فلکه باير مانده بود، ساختماني در چهار طبقه بنا گرديد و به دو مدرسه‏ي مذکور متصل شد يک واحد به نام «دانشگاه علوم اسلامي رضوي» به وجود آمد که هم اکنون آماده و مورد استفاده مي‏باشد. ما در اين مورد با آقاي مهندس رضا ديشيدي طراح و مجري اين ساختمان‏ها مذاکراتي انجام داده‏ايم که اکنون به نظر خوانندگان محترم مي‏رسانيم، آقاي ديشيدي [ صفحه 376] فرمودند: ابتدا قرار بود مدرسه‏ي ميرزاجعفر تعمير شود ولي به علت اين که رطوبت زمين با رطوبت سقف به هم رسيده بود، تعمير و بازسازي امکان نداشت و اين فکر منتفي گرديد. بعدا طرحي تهيه شد، آن قسمت از مدرسه که هنر اصيل دارد حفظ شود مانند سردرهاي مدرسه و اطاق کتاب‏خانه و بقيه خراب گردد، قبل از تخريب، از مدرسه نقشه‏برداري گرديد و عکس‏هائي هم گرفته شد، و بعد بر طبق نقشه اول بنا گرديد و مانند اول از کار درآمد، و مدرسه خيرات خان که ساده بود و نماي هنري نداشت آن هم مانند مدرسه ميرزاجعفر تخريب و از نو ساخته شد. مدرسه ميرزاجعفر و خيرات خان پس از اتمام ساختمان به بناهاي جديد اتصال پيدا کرد و به صورت يک مجموعه درآمد، که اکنون به نام دانشگاه علوم اسلامي رضوي معروف شده است، در اين مجموعه کوشش شده که معماري قديم حفظ شود و نوآوري‏ها با هنرهاي قديم تلفيق گردد اين بناها روي هم رفته بيست و دو هزار متر مربع زير بنا دارد. در اين مجموعه دويست و پنجاه اطاق، هفت مدرس، يک آمفي تأتر، يک کتاب‏خانه کوچک و يک سالن بزرگ اجتماعات، که در حدود هفت صد نفر در آن جاي مي‏گيرند، يک سالن غذاخوري، قسمت اداري، رختشوي خانه، يک مسجد و بيست و دو عدد کلاس ساخته شده است. پايان گفته‏هاي مهندس ديشيدي. مدرسه ميرزاجعفر که اکنون جزء اين مجموعه شده از بناهاي قديم شهر مقدس مشهد مي‏باشد که ما انشاء الله تاسيس آن را در تاريخ مشهد مقدس ضمن شرح مدارس علميه ذکر خواهيم کرد ولي خصوصيات آن را در اين جا به نظر خوانندگان مي‏رسانيم. اين مدرسه در جوار حرم مطهر حضرت رضا عليه‏السلام در قسمت شمالي صحن کهنه قرار دارد، حياط آن مربع مستطيل بسيار با روح و با صفا و نشاطانگيز است، کف مدرسه با سنگ‏هاي خلج شش گوشه فرش شده و ازاره آن در چهار طرف با سنگ‏هاي مرمر پوشيده گرديده است. در وسط حياط حوضي بزرگ به شکل مربع مستطيل ساخته شده و فواره‏هائي هم کارگذاشته شده‏اند. [ صفحه 377] اطراف حوض گل‏کاري شده و اشجار گوناگوني در آن غرس گرديده که فضاي مدرسه را بسيار زيبا نموده است، در اين مدرسه دو ايوان در طرف شمال و جنوب قرار گرفته و مدرسه دو طبقه است که طبقه زير به اندازه دو متر از سطح حيات بالاتر مي‏باشد و زير اطاق‏ها همه خالي است. در اين مدرسه 52 حجره مي‏باشد که در مقابل هر يک از آن‏ها ايواني هم قرار دارد. براي رفت و آمد ساکنان مدرسه به اطاق‏هاي بالا و پائين شانزده راهرو ساخته شده که طلاب و محصلين از آن‏ها رفت و آمد مي‏کنند، در مدخل مدرسه از طرف صحن کهنه دو مدرس بزرگ ساخته شده که طلاب در آن جا درس فرا مي‏گيرند، اين مدرس‏ها با کاشي‏هاي رنگارنگ و زيبا و کتيبه‏هاي گوناگون آراسته شده‏اند و بينندگان را به طرف خود جذب مي‏کنند. تمام ايوان‏ها و ديوارها و بدنه‏هاي اين مدرسه با کاشي‏هاي الوان و زيبا مزين شده و جلال و شکوه خاصي به مدرسه داده است، تمام درها و پنجره‏هاي حجرات بالا و پائين از چوب ساخته شده و پنجره‏ها همه مشبک هستند، کساني که وارد مدرسه مي‏شوند، مجذوب فضا و بناي آن مي‏گردند و بر سازندگان آن درود مي‏فرستند. اين مدرسه سال‏ها متروک و غريب بود، در اين اواخر به صورت انبار آستان قدس درآمده بود، هر کس مي‏خواست آن را بسازد اداره‏ي باستان‏شناسي به بهانه‏هائي جلوگيري مي‏کرد نه خود آن را مي‏ساخت و نه مي‏گذاشت ديگران آن را بسازند، ولي بعد از پيروزي انقلاب اسلامي آن سدها شکست و موانع برطرف گرديد و اينک مدرسه به صورتي مجلل معمور و آباد شده است، خداوند جزاي خير به بانيان آن بدهد.