همان گونه که قبلا تذکر داديم در زمين‏هاي پشت مدرسه ميرزاجعفر و خيرات‏خان که از مدارس قديم مشهد مقدس مي‏باشند و در تخريب فلکه سالم ماندند، اطاق‏ها و حجرات زيادي درست شد و براي محصلان و طلاب علوم ديني آماده گرديد، اين ساختمان در سه طبقه بنا گرديده و بسيار زيبا و مجلل ساخته شده است. ما در هنگام معرفي مجموعه اين حوزه مقدسه در اين باره سخن گفته‏ايم و خصوصيات آن را روشن کرده‏ايم، اين مجموعه‏ي جديد به مدرسه خيرات از طريق ايوان شمالي راه دارد و طلاب از آن رفت و آمد مي‏کنند، در مدخل اين ساختمان از طريق مدرسه خيرات‏خان سنگي بر ديوار نصب شده و در آن چنين نوشته شده است: بسم الله الرحمن الرحيم با تاييدات خداوند متعال و عنايات حضرت ثامن‏الائمه علي بن موسي الرضا عليه‏السلام از برکت پيروزي انقلاب اسلامي ايران و رهبري داهيانه مرجع عالي‏قدر جهان اسلام و رهبر کبير انقلاب حضرت آيةالله العظمي امام خميني مد ظله العالي در اواخر سال 1358 علي رغم مشکلات اداري به منظور فراهم کردن محيط آموزش مناسب براي طلاب علوم ديني. دو مدرسه مخروبه ميرزاجعفر و خيرات‏خان از محل عوائد آستان قدس رضوي به [ صفحه 389] صورت دانشگاه علوم اسلامي رضوي درآمد و در تاريخ يازدهم ذي‏قعده سال 1404 هجري قمري برابر با هجدهم مرداد 1363 شمسي همزمان با تشکيل کنگره جهاني حضرت رضا عليه‏السلام رسما افتتاح شد. اين بناي جديد داراي 206 حجره خواب خواب براي طلاب و 18 کلاس درس و اتاق امور اداري و يک سالن سخنراني، و کتابخانه و مسجد و مدرس، کتاب‏فروشي، و نيز سالن بزرگ غذاخوري و رختشوي خانه و دستگاه حرارت و برودت مرکزي مي‏باشد، مساحت کل زير بناي آن بالغ بر بيست و دو هزار متر مربع مي‏باشد. با وجود محدوديت‏هائي که در ارتفاع ساختمان و ارتباطات داخلي آن بود مجريان طرح موفق شدند، تلفيقي از معماري قديم و جديد بنمايند و با حفظ صورت سنتي و اصلي دو مدرسه احداث تمام و مسائل رفاهي جديد در آن، زيبائي ظاهري آن را نيز رعايت کنند، چنان چه در برنامه تحصيلي دانشگاه نيز با اين که اصالت به حوزه و دروس اسلامي داده شده. اما از دروس جديد هم آن چه براي طلاب ضروري و مفيد دانسته شد منظور گرديد، تا توسط استادان مجرب متدين تدريس شود، اميد است، دانشجويان و طلاب علم که در اين دانشگاه به تحصيل اشتغال مي‏ورزند، تحت توجهات حضرت ولي عصر حجة بن الحسن العسگري عجل الله تعالي فرجه موفق شوند. از فرصتي که نتيجه جانبازي امت مسلمان ما و استقرار حکومت جمهوري اسلامي ايران و حسن تدبير مسئولان امور حداکثر استفاده را بنمايند وخود را به زينت علم و عمل، تقوي و فضائل اخلاقي بيارايند تا بتوانند در آينده به ترويج حقائق اسلامي و معارف قرآني بپردازند و فقه و حقوق و مباني اعتقادي تشيع را نشر دهند. بعون الله تعالي و هو خير موفق و معين، نماينده امام و توليت آستان قدس رضوي عباس واعظ طبسي - خط مصطفي مهدي‏زاده. [ صفحه 390]